Постійне вживання продуктів на основі ефективних мікроорганізмів створює сприятливі мікроелементи для розвитку рослин. Рослини, які ростуть і плодоносять в таких умовах, набагато стійкіші до стресів, спричинених погодними умовами або нестачею певних поживних речовин. З іншого боку, такі рослини характеризуються виробництвом однорідних щеплень, які своєчасно дозрівають і мають виняткову харчову цінність. Вплив цих продуктів не лише негайний, під час виробництва, його також можна побачити й після збору врожаю, оскільки такі плоди є більш витривалими та легше зберігаються. Продукти EM зміцнюють бджолині спільноти і підвищують врожайність меду Продукти на основі ефективних мікроорганізмів в останні роки завдяки своїм позитивним ефектам займають значне місце у бджільництві. Вони в основному використовуються для поліпшення імунної системи бджіл, що у загальному підсумку сприяє кращій продуктивності. Крім того, їх використовують для зменшення негативного впливу найзначніших шкідників на бджолину спільноту (американський та європейський гнилець, кліщ варроа, воскова міль). Пробіотики на основі ефективних мікроорганізмів діють, захищаючи слизову кишківника бджіл і збагачуючи її корисною флорою, що зменшує можливість розвитку кишкових захворювань — ноземозу. Їх застосовують, додаючи у рідку їжу (сиропи) або в не дуже холодну, нехлоровану воду. Крім того, нерідкі випадки їх використання в гігієнічних поїлках. Досвід показує, що бджоли набагато спокійніші, коли п’ють воду, до якої додано пробіотик на основі ефективних мікроорганізмів. Комплексність дії корисних мікроорганізмів Підхід до дії корисних мікроорганізмів є комплексним і не може обмежуватися безпосереднім виробництвом їжі. Корисні мікроорганізми також використовуються для очищення води, дезінфекції житлової площі та простору, призначеного для утримання тварин, компостування та виробництва органічних речовин. Їх дія є цілісною і вони застосовуються "від поля до столу".