Реакция почвы (рН) является важной характеристикой по нескольким причинам. В щелочных почвах с высокими значениями рН (> 7,5) питания растений железом и некоторыми микроэлементами затруднено, что приводит к появлению хлороза в некоторых чувствительных видов. С другой стороны, доступность большинства микроэлементов и тяжелых металлов значительно увеличивается, поэтому они могут накапливаться и привести потенциально вредное содержание в растительном материале (выше предельно разрешенных концентраций). Поэтому лучшие почвы для выращивания лекарственных растений является от слабокислой до нейтральной реакции (рН 5,5 - 7,0). Кроме того, почва не должен загрязняться потенциально вредными веществами (остатками пестицидов, тяжелыми металлами и т.д.) и обязательно должен находиться на безопасном расстоянии от источников загрязнения атмосферного воздуха (заводов, автомагистралей и т.д.). Некоторые почвы естественно содержат повышенное количество доступных микроэлементов и тяжелых металлов, что может повлиять на их увеличенное накопление в растениях и, таким образом, значительно ухудшить качество урожая. По всем этим причинам перед посевом или посадкой обязательным является проведение физико-химического анализа почвы на участках, где планируется выращивание лекарственных растений. Для органического производства, в частности, следует определять состояние по содержанию тяжелых металлов и возможных остатков пестицидов.