Среди самых опасных вредителей шпината следует назвать свекловичную муху (Pegomya betae). Нападение распознается по поднятому лиственному эпидермису в виде пузырьков, заселенных личинками без головы и ног. Паразит развивается в условиях очень высокой влажности (оптимально 90%), в течение сезона формируются 3-5 поколений, а профилактическая обработка необходима только в том случае, если на обратной стороне молодых листьев проявляют попарно отложенные продолговатые и белые яйца. Шпинат может быть атакован и другими вредителями, например, почвенными вредителями, жуками, солитерами, нематодами, корневыми мухами, земляными совками, тлями и слизнями. Важно выявить вредителя и применить эффективный инсектицид соответствии с ограничениями! Например, имидаклоприд очень эффективен против тлей, метоксифензоид и метафлумизон - против гусениц тли, спиносад - против вредных мух и гусениц, а синтетические пиретроиды (лямбда-цигалотрин, дельтаметрин) действуют против тли и гусениц. Болезни растений из группы фитофтороза и мучнистой росы, как правило, распространяются по всей площади выращивания. В оптимальных условиях влажности и температуры быстро распространяются, а на лиственных овощах труднее контролировать прямыми мерами из-за ограничений и небольшого количества разрешенных фунгицидов.