Есть несколько причин гниения георгин. Гниль, вызванная грибком Sclerotinia, - распространенное заболевание георгин. Этот грибок также поражает и другие виды цветов. Проникает в корни, распространяется на все части растения, но в основном поражает клубни и нижнюю часть стебля. Зараженные ткани размягчаются, разжижаются и образуют обильный беловатый налет из мицелия и спор грибов. Позже появляются черные твердые тела - склероции. При поражении корневой части стебля растения желтеют и погибают. Заболевание развивается в условиях повышенной влажности, особенно в дождливые годы. Сильнее проявляется в тяжелых и кислых почвах. В клубнях инфекция продолжает развиваться во время хранения. Не стоит выращивать георгины на сильно зараженных участках почвы.

Сухая гниль, вызываемая грибами Fusarium и Verticillium, также может возникать на клубнях георгинов при хранении. Клубни засыхают, буреют и на них образуются скопления спор - розовых или коричневых. Сильно поражаются слабые, незрелые и плохо просушенные клубни. Когда такие клубни высаживаются, инфекция распространяется на растения и приводит к их увяданию.

Также грибки развиваются на листьях георгинов и вызывают появление круглых желто-зеленых пятен диаметром от 2 до 10 мм. Позже пятна становятся желто-коричневыми или темно-коричневыми. Листья засыхают и опадают. Разросшиеся одиночные листья следует немедленно уничтожить. В случае более сильного нашествия грибка, его можно опрыскать 10% бордоской смесью. Также георгины поражаются вирусными заболеваниями. Листья желтеют, растения отстают в развитии, приобретают кустистую форму и плохо цветут. В конце концов они умирают. Вирусные заболевания передаются тлей.