Большое значение имеет сбор и уничтожение растительного мусора. В зараженном мусоре растений сохраняется и передается большое количество возбудителей болезней, прежде всего корневая гниль, которая повреждает наземную часть растения и приводит к ее увяданию. В конце производственного цикла после сбора урожая необходимо удалить и уничтожить все как зараженные, так и незараженные растительные остатки. Это мероприятие особенно желательно в защищенных местах (например, в теплицах), где из-за отсутствия атмосферных воздействий разложение растительных остатков происходит очень медленно. Кроме этого, на защищенных территориях необходимо продезинфицировать почву, конструкции, сооружения, инструменты и принадлежности, ящики и семена при производстве саженцев. Лучший период для дезинфекции почвы - осень, ведь тогда, кроме бактерий, вирусов и грибов, существуют также насекомые в различных стадиях развития, зимующие в почве. Контроль сорняков необходимо проводить до начала производственного цикла. Одним из важнейших профилактических мероприятий является гигиена работников (мытье рук, одежды, дезинфекция обуви) и запрет курить в защищенной зоне.