Концы веточек с чешуйчатыми листьями используются в лечебных целях. Их собирают в течение года, сушат тонким слоем в затененном месте. Эти части содержат масло с основным компонентом туйон, гликозиды, также сахар, смолу, воск, флавоноиды, дубильные кислоту и другие вещества.

Масло обладает противовирусным действием. Поэтому ее используют для лечения вирусных бородавок и кожных инфекций. Также применяется при респираторных инфекциях для лечения бронхита и облегчения отхаркивания. Она также используется как средство от потоотделения и мочеиспускания и при болях в суставах.

Масло из шишек используют при ревматизме, подагре, отеках, против головной боли и др. Очень важно, чтобы туя применялась при нарушениях менструального цикла, рака матки и против паразитов. Туя достигает очень хороших результатов при ящуре (вирусная болезнь крупного рогатого скота) и воспалении копыт у лошадей.

Туя содержит ядовитое вещество туйон, поэтому необходимо обращать внимание на дозу при внутреннем применении, не следует допускать передозировки, так как это может привести к тяжелому отравлению. Туя может вызвать выкидыш, и поэтому беременным женщинам не следует применять ее в любой форме.