Зберігання соняшника — це важка і відповідальна робота, завдяки високому вмісту олії в зерні. Якщо відсоток олії становить 44%, а вологість повітря близько 10%, ферменти, що розщеплюють жир, можуть активізуватися, а білок - розщепитися, таким чином, знижуючи значення їжі. Насіння добре зберігається з вологістю 6-7%. Зберігати соняшник без сушіння неможливо (тут температура повітря не повинна перевищувати 40 ° C).