Реакція ґрунту (рН) є важливою характеристикою з кількох причин. У лужних ґрунтах з високими значеннями рН (> 7,5) живлення рослин залізом та деякими мікроелементами ускладнене, що призводить до появи хлорозу у деяких чутливих видів. З іншого боку, доступність більшості мікроелементів та важких металів значно збільшується, тому вони можуть накопичуватись і спричинити потенційно шкідливий вміст у рослинному матеріалі (вище гранично дозволених концентрацій). Тому найкращі ґрунти для вирощування лікарських рослин є від слабокислої до нейтральної реакції (рН 5,5 - 7,0). Крім того, ґрунт не повинен забруднюватися потенційно шкідливими речовинами (залишками пестицидів, важкими металами тощо) і обов’язково повинен знаходитися на безпечній відстані від джерел забруднення атмосферного повітря (заводів, автомагістралей тощо). Деякі ґрунти природно містять підвищену кількість доступних мікроелементів та важких металів, що може вплинути на їх збільшення накопичення в рослинах і, таким чином, значно погіршити якість врожаю. З усіх цих причин перед посівом або посадкою обов’язковим є проведення фізико-хімічного аналізу ґрунту на ділянках, де планується вирощування лікарських рослин. Для органічного виробництва, зокрема, слід визначати стан щодо вмісту важких металів та можливих залишків пестицидів.