Інститут є головною науковою установою з проблем селекційного вдосконалення великої рогатої худоби і збереження біорізноманіття сільськогосподарських тварин. В Інституті функціонує Банк генетичних ресурсів тварин з філіями у регіонах України, який віднесений до наукових об’єктів, що становлять національне надбання (розпорядження КМУ від 19.08.2002р. № 472-р.). Основні напрями наукової діяльності: правове і нормативне забезпечення функціонування, розроблення і впровадження систем селекції у скотарстві на популяційному рівні; розроблення методологічних засад функціонування і формування загальнодержавної інформаційної бази даних у скотарстві; нормативне і методологічне забезпечення впровадження системи ДНК-діагностики та елементів геномної селекції сільськогосподарських тварин; науково-методичне забезпечення і здійснення оцінки біологічного різноманіття, збереження генофонду сільськогосподарських тварин in situ та ex situ та раціонального використання генофонду сільськогосподарських тварин.у контексті членства України у Європейському регіональному центрі генетичних ресурсів тварин (European Regional Focal Point for Animal Genetic Resources, ERFP) FАО; вдосконалення існуючих та розроблення нових біотехнологічних методів у тваринництві; застосування методів ранньої діагностики тільності, корекції функції відтворення у високопродуктивних корів