Як і у будь-якого іншого продукту у зеленої цибулі є і свої протипоказання до вживання, а саме:

• людям, які мають порушення в роботі шлунково-кишкового тракту (гастрити, ентерити, коліти). Сік цибулі має подразнюючу дію на слизові і уражені ділянки шлунка, а також може викликати печію.

• людям, які мають захворювання серцево-судинної системи (інфаркти, тромбофлебіти, інсульти, тромбози, варикозне розширення вен). Вітамін К в складі зеленої цибулі збільшує згортання крові, що може негативно позначитися на людях, що мають дані захворювання.