Постоянное употребление продуктов на основе эффективных микроорганизмов создает благоприятные микроклиматические и микронутриентные условия для развития растений. Растения, которые растут и плодоносят в таких условиях, намного более устойчивы к стрессу, вызванному погодными условиями или недостатком определенных питательных веществ. С другой стороны, такие растения характеризуются образованием однородных прививок, которые своевременно созревают и обладают исключительной питательной ценностью. Воздействие этих продуктов отражается после сбора урожая, потому что такие фрукты более долговечны и их легче хранить. Продукты EM укрепляют пчелиные сообщества и повышают урожайность меда Продукты на основе эффективных микроорганизмов в последние годы благодаря своим положительным эффектам занимают значительное место в пчеловодстве. Они в основном используются для улучшения иммунной системы пчел, в общем итоге способствует лучшей производительности. Кроме того, их используют для уменьшения негативного влияния крупнейших вредителей на пчелиное сообщество (американский и европейский гнилец, клещ варроа, восковая моль). Пробиотики на основе эффективных микроорганизмов действуют, защищая слизистую кишечника пчел и обогащая ее полезной флорой, уменьшает возможность развития кишечных заболеваний - нозематозу. Их применяют, добавляя в жидкую пищу (сиропы) или в не очень холодную, не хлорированную воду. Кроме того, нередки случаи их использования в гигиенических поилках. Опыт показывает, что пчелы гораздо спокойнее, когда пьют воду, к которой добавлен пробиотик на основе эффективных микроорганизмов. Подход к действию полезных микроорганизмов является комплексным и не может ограничиваться непосредственным производством пищи. Полезные микроорганизмы также используются для очистки воды, дезинфекции жилой площади и пространства, предназначенного для содержания животных , компостирования и производства органических веществ.