Не щадят этот вид и грибковые заболевания, среди которых наиболее распространены Didymascella thujina, вызывающая бурую пятнистость побегов туи. Симптомами этого заболевания являются небольшие белесые участки, появляются на верхней стороне годовалого письмо, после чего можно заметить небольшие темно-коричневые пятна, представляющие плодовые тела. Также на молодых побегах зимой можно наблюдать отдельные коричневые листовые чешуи. В случае более сильного поражения листья полностью буреют и осенью опадают, а инфицированные, которые не опали, приобретают пепельно-серый цвет. По мере развития болезни дерево в нижней части приобретает вид обгоревшего ствола, а крона становится истонченной. Некоторые меры защиты растений от грибковых атак: использование чистых, не зараженных черенков; регулярная замена клумбы для выращивания рассады; многократное использование фунгицидов в питомнике в течение вегетации. Еще одно грибковое заболевание, которое распространено на туях, что вызывает гибель побегов, вызванное грибом Kabatina thujae, и появляется на растениях, которые росли на почвах, бедных калием и магнием. Нападение чаще наблюдается, если туя растет во влажных условиях и в плотном комплексе, похожем на живую изгородь. На коре ветвей зараженного растения с помощью лупы видно маленькие черные пунктирные плодовые тела. В редких случаях молодые деревья могут погибнуть, но чаще всего погибают только верхние ветви. Защиту фунгицидами безопаснее проводить профилактически во время вегетации. Также мы проводим профилактическую защиту (зимой, в фазе покоя, но когда температура выше 5 ° C) комбинацией минеральных масел и соединений меди. Минеральное масло имеет инсектицидное действие, а соединения меди служат фунгицидной защитой.