Перманганат калію завдяки своїм властивостям може бути використаний у сільському господарстві для дезінфекції насіння та цибулин. Окрім дезінфекції посадкового матеріалу, його також можна використовувати для знезараження ґрунту, інструментів та захисту рослин. Варто відзначити, що розчин перманганату калію не діє на шкідників, а лише на збудників хвороб. Коли перманганат калію використовують для дезінфекції насіння та іншого посадкового матеріалу, його застосовують як слабкий розчин, тобто рідину низької концентрації. Застосовують розчин, що має концентрацію 0,5% і характеризується світло-рожевим (блідо-рожевим) кольором. З перманганатом калію слід поводитися обережно, добре розраховувати дозу та зберігати в недоступному для дітей місці. Зберігайте розчин у темному скляному посуді в темному місці, оскільки під впливом сонячного світла він розкладається і втрачає свою ефективність. При контакті зі шкірою кристали перманганату калію можуть бути корозійними. У сільському господарстві його слід застосовувати обережно, у менших концентраціях, оскільки це також може завдати шкоди рослинам. Якщо для поливу використовувати розчин вищої концентрації (темного кольору), він може спалити коріння рослин. Тому, як добриво, його використовувати не варто.