Кроме положительного влияния на физические свойства почвы, возрастающее значение зеленого навоза отводится гигиене почвы из-за наличия меньшего количества посевов в севообороте, особенно при посеве сидератов, уменьшающие зараженность почвы нематодами (гречкой, горчицей). Время посева сидерата зависит от того, к какой культуре мы хотим подготовить почву, будет ли она интерполированна между двумя основными культурами, как предпосевная, как кровельная культура или реже основная культура будет использоваться как кормовая культура. Посевы, которые не переносят себя, такие как: рапс, клевер красный, люцерна и горох, включаются в севооборот только через три года. Посев сидератов после известкования, особенно кальцифильных культур: рапс, рапс масличный, горчицу, применяют перед посевом основной культуры, чтобы уменьшить негативное влияние известкования на основной урожай. Для обеспечения положительного эффекта зеленого навоза важно определить точное время пахоты сидератов. Большинство растений для зеленого навоза вспахивают после цветения, измельчая надземную массу и внося ее в почву за две-три недели до посева основной культуры. Таким образом достигается постепенное разложение введенного органического вещества и легче всасывание питательных веществ. Для устойчивого управления и предотвращения деградации почвы посев сидератов должен быть, кроме экологической осведомленности и эффективности, необходимой мерой и неотъемлемой частью любого многолетнего севооборота.