Згідно з досвідом в теплі весняні дні (понад 10 °C у повітрі навколо теплиці) можна спостерігати зимуючі популяції попелиць, блішок, білих мух та каліфорнійського трипса. Для спостереження за популяцією цих шкідників у теплицях рекомендуємо підвісити над саджанцями клейкі дошки жовтого та синього кольорів. Якщо помічена початкова поява одного зі згаданих паразитів на розсаді помідорів, перцю, капусти, огірків, салату чи декоративних рослин, ми радимо використовувати інсектициди. Для профілактичного захисту молодих рослин та проти хвороби вилягання доцільно використовувати фунгіциди. Крім того, оскільки насіння несе у собі велику кількість мікроорганізмів, патогенів, збудників хвороб для виробництва саджанців обов’язково треба використовувати сертифіковане та оброблене насіння, за винятком цінних корінних екопопуляцій овочів та стерилізованих субстратів. Перед тим, як висаджувати рослини в теплиці, ми рекомендуємо попередньо обробити розсаду препаратами, що містять аміно- і гумінові кислоти, вітаміни або екстракти морських водоростей або фізіологічні біостимулятори. Через різницю температури повітря між теплими днями та холодними ночами можливі небажані опіки молодих рослин, тому їх потрібно обприскувати вищезазначеними розчинами амінокислот. Регулярно контролюйте атмосферу в теплиці та не допускайте конденсації води на даху. Підкреслимо, що виробники в органічному виробництві можуть профілактично використовувати мікробіологічні препарати на основі корисного гриба Trichoderma spp. Їх застосовують у форматі препарату для поливу пересаджених рослин або для крапельних систем.