Що стосується боротьби з мікотоксинами, вона повинна бути детальною та стратегічною. В епоху сучасного сільського господарства залишати ситуацію без уваги є великою розкішшю. Ми починаємо боротьбу в полі з правильної та своєчасної обробки та захисту посівів, найчастіше це фузаріоз зерна. Також подбайте про гігієну під час транспортування та зберігання. Зернові культури слід розміщувати на очищених та дезінфікованих складах, зберігати зерно з вмістом вологи нижче 13%. У процесі виробництва сумішей для кормів для тварин звертайте увагу на гігієну змішувачів та обладнання. Рекомендується використовувати препарати, які діють як інактиватори при виробництві силосу. Також варто виготовляти препарати для знищення мікотоксинів. В основному це препарати на мінеральній основі, найчастіше цеоліти, змішані з поживними речовинами при виробництві кормів для тварин. Контроль та вимірювання рівня мікотоксину в продуктах для споживання людиною також є одним з дуже важливих аспектів боротьби.