Одночасно з поливом може проводитися підгодівля водорозчинними добривами або застосовуватися поживний розчин. У такому випадку ми говоримо про фертигацію, тобто спосіб внесення рідких добрив або пестицидів, одночасно зі здійсненням зрошення (поливу). При фертигації слід бути обережним, оскільки оброблені культури чутливі до занадто високої концентрації поживного розчину. Підземне зрошення (субіррігацію) застосовують у виробництві розсади на столах, пропускаючи воду в канавки на поверхні столу, звідки вона капілярними силами підіймається до рівня коренів. Особливостями зрошувальної системи в спорудах захищеного ґрунту є: низька інтенсивність зрошення (близько 5 мм / год); місцеве зрошення з можливістю визначення розміру зони змочування (поверхневого та просторового); певний розмір крапель і форма струменя (з можливістю зміни режиму з дощу на росу та запотівання); мобільність та пристосованість (можливість переміщення та пристосування до форми та розміру заповідного простору); можливість здійснення фертигації. Щоб вирощувати овочі в спорудах захищеного ґрунту, потрібно постійно забезпечувати рослин достатньою кількістю води в шарі ґрунту, в якому розвивається основна частина коренів. Вологість ґрунту слід підтримувати на рівні від 70 до 80%. Підраховано, що щорічно потрібно близько 1,5 м³ води / м² поверхні. Оптимальна кількість води, що подається під час зрошення, становить 15 мм для легких ґрунтів та 15-25 мм для важчих ґрунтів. Для зволоження поверхневого шару ґрунту достатньо 2-3 мм. Для зволоження сухих ґрунтів для полегшення обробки поверхні або кращої дії гербіцидів рекомендується замочувати 5 мм у вигляді дощу. Для посіву або посадки потрібно 10-15 мм. Зрошення дощем проводять протягом дня, щоб до вечора рослини підсохли, завдяки цьому зменшується ризик зараження хворобами. Систему дощового зрошення можна також використовувати протягом літніх місяців для зниження температури в спорудах захищеного ґрунту за допомогою мікроспринклерів.