Хвороби кипарисовика і його шкідники псують красу рослини. При поганому догляді або несприятливих умовах середовища потрібна профілактика і лікування хвороб і шкідників кипарисовика.
Стоколосова муха — це крихітна жовтувата блискуча муха завдовжки близько 3 мм. Комахи пошкоджують насіння стоколосу безостого і деяких інших культур. Окремі стебла трави гинуть через сверлячу активность черв'ячків.