Інститут засновано в 1929 роціу м.Харкові. З 1990 р. Інститут перебуває у складі Національної академії аграрних наук України. У 2011 році Інститут отримав назву — Інститут водних проблем і меліорації Національної академії аграрних наук України (ІВПіМ). Основнінапрями наукової діяльності: водні ресурси (стан, раціональне використання, охорона, відтворення); сільськогосподарське водопостачання та водовідведення; захист сільських територій і населених пунктів від шкідливої дії вод; сільськогосподарські меліорації та використання меліорованих земель; будівництво та експлуатація меліоративних і водогосподарських систем та споруд; екологія водних об’єктів і меліорованих земель.