Кокцидии (Coccidia) - очень мелкие формы простейших, размеры которых достигают всего нескольких микрометров. Их клетки не дифференцированы на отделы, как, к примеру, у грегарин. Это внутриклеточные паразиты, половой процесс у них происходит по типу анизо- или оогамии. При этом женский гамонт (макрогамонт) производит макрогамету (яйцеклетку), а мужской (микрогамонт) - несколько микрогамет (сперматозоидов). Преимущественно паразиты позвоночных, в том числе и человека, реже - беспозвоночных. Вызывают ряд тяжелых заболеваний. Известно около 2500 видов. Собственно кокцидии (Eimeriina) - в основном паразиты птиц и млекопитающих. Отдельные виды поражают представителей других групп позвоночных и различных беспозвоночных животных (кольчатых червей, моллюсков, членистоногих). Заболевания, которые они вызывают, называют кокцидиоз. Обычно Кокцидиям присуща узкая специфичность: они паразитируют в организме того или иного вида хозяина, локализуются лишь в определенных органах или тканях. В жизненном цикле кокцидий, как правило, чередуются шизогония, половой процесс и спорогония, то есть чередование полового и двух бесполых поколений. Жизненный цикл может сопровождаться сменой хозяев. Виды рода Eimeria - паразиты кишечника и других органов различных видов молодняка животных: крольчат, телят, цыплят, утят, и тому подобное. Большинство видов локализуется в цитоплазме клеток, некоторые - в ядре (E. ranarum - паразит лягушки) или на поверхности клеток (E. anguillidae - из кишечника угря). Вызывают смертельно опасные заболевания молодняка домашних млекопитающих и птиц: E. bovis - коров, E. leuckarti - лошадей, E. tenella - кур, E. trunсata - гусей. К кокцидиям, развивающимся с участием промежуточных хозяев, принадлежит паразит многих видов теплокровных и человека - Toxoplasma gondii. По некоторым оценкам до от 70% до 80% населения мира заражены этим паразитом. К кокцидиям относятся также мясные споровики (род Sarcocystis) - широко известные паразиты мышц млекопитающих.