Кокцидії (Coccidia) – дуже дрібні форми найпростіших, розміри яких сягають усього кількох мікрометрів. Їхні клітини не диференційовані на відділи, як у грегарин. Це – внутріклітинні паразити, статевий процес у них відбувається по типу анізо- або оогамії. При цьому жіночий гамонт (макрогамонт) дає початок макрогаметі (яйцеклітині), а чоловічий (мікрогамонт) – кільком мікрогаметам (сперматозоїдам). Переважно паразити хребетних, у тому числі і людини, рідше – безхребетних. Викликають ряд тяжких захворювань. Відомо біля 2 500 видів. Власне кокцидії (Eimeriina) – в основному паразити птахів та ссавців. Окремі види уражують представників інших груп хребетних та різних безхребетних тварин (кільчаків, молюсків, членистоногих). Захворювання, які вони викликають, називають кокцидіозами. Зазвичай кокцидіям притаманна вузька специфічність: вони паразитують в організмі того чи іншого виду хазяїна, локалізуючись лише у певних органах чи тканинах. У життєвому циклі кокцидій, як правило, чергуються шизогонія, статевий процес та спорогонія, тобто чергування статевого та двох нестатевих поколінь. Життєвий цикл може супроводжуватись зміною хазяїв. Види роду Eimeria – паразити кишечника та інших органів різних видів молоді тварин: кроленят, телят, курчат, каченят, тощо. Більшість видів локалізується у цитоплазмі клітин, деякі – в ядрі (E. ranarum – паразит жаби) або на поверхні клітин (E. anguillidae – з кишечника вугря). Викликають смертельно небезпечні захворювання молодняка свійських ссавців та птахів: E. bovis – корів, E. leuckarti – коней, E. tenella – курей, E. trunсata – гусей. До кокцидій, що розвиваються за участю проміжних хазяїв, належить паразит багатьох видів теплокровних та людини – Toxoplasma gondii. За деякими оцінками до від 70% до 80% населення світу інвазовані цим паразитом. До кокцидій належать також м’ясні споровики (рід Sarcocystis) – широко відомі паразити м’язів ссавців.