Як і кожен овоч, цибуля має свої протипоказання до вживання. Зелений овоч не рекомендується включати до свого раціону при наступних порушеннях у роботі організму, що перебувають у гострій стадії перебігу:

• гастрит;

• виразка;

• запалення печінки;

• панкреатит;

• мочекам'яна хвороба;

• запалення жовчного міхура;

• підвищена кислотність шлунка.