Велике значення має збір та знищення рослинного сміття. У зараженому смітті рослин зберігається і передається велика кількість збудників хвороб, насамперед коренева гниль, яка пошкоджує наземну частину рослини та призводить до її в’янення. В кінці виробничого циклу після збору врожаю необхідно видалити та знищити всі як заражені, так і незаражені рослинні залишки. Цей захід особливо бажаний у захищених місцях (наприклад, в теплицях), де через відсутність атмосферних впливів розкладання рослинних залишків відбувається дуже повільно. Крім цього, на захищених територіях необхідно продезінфікувати ґрунт, структуру споруди, інструменти та приладдя, ящики та насіння під час виробництва саджанців. Найкращий період для дезінфекції ґрунту - осінь, адже тоді, крім бактерій, вірусів та грибів, існують також різні стадії комах, які зимують у ґрунті. Контроль бур’янів необхідно проводити до початку виробничого циклу. Одним з найважливіших профілактичних заходів є гігієна працівників (миття рук, одягу, дезінфекція взуття) та заборона палити в охоронюваній зоні.