Рассаду можно выращивать в инкубаториях, низких или высоких туннелях. В таких пространствах формируются грядки шириной 1-1,2 м, на которых их высевают вручную с междурядьями 10-15 см и расстоянием между растениями 2-3 см. Обычно после посева и полива горшки и грядки накрывают текстильным волокном или бумагой, чтобы поддерживать влагу до появления первых признаков прорастания. Во время роста рассады на грядках или в горшках важно поддерживать оптимальную дневную и ночную температуру, поддерживать оптимальную влажность и хорошее освещение. Выращивая рассаду томатов в оптимальных условиях быстрее достигается необходимый размер саженца (5-9 листьев, высота 15-25 см). Из-за возможного появления болезней растений и ущерб, причиненный вредными организмами, томаты следует выращивать в многолетнем севообороте. Правильный севооборот при органическом выращивании томатов является профилактической мерой для поддержания здоровья растений, плодородия и биологической активности почвы. При выращивании овощей садоводы используют смешанные или комбинированные посадки в садах. Посадка помидоров с другими видами овощей и цветов предотвращает появление сорняков и вредных насекомых естественным путем. Хорошим соседом помидоров оказались сельдерей, чеснок, фасоль, капуста, лук-порей, свекла, салат, цикорий, морковь, петрушка. Настурция, посеянная рядом с помидором, защищает его от тли, а бархатцы от нематод. Сочетание капусты и помидоров особенно эффективно, поскольку помидор отпугивает Капустница. Горох, укроп и картофель оказались плохими соседями томатов. Высаживая рассаду томатов в открытом грунте следует позаботиться о том, чтобы погодные условия были подобны тем, которые были в рассаде, поскольку помидоры очень чувствительны к холоду.