Первое и основное мероприятие - севооборот: не рекомендуется сажать лук на одном месте 4 года подряд. Его следует посадить как минимум на 400 м дальше от соседних плантаций лука и тех мест, где его сажали в прошлом году. Лук можно защитить от вредителя путем выщипывания или удаления зараженных частей и более раннего или позднего посева растения. На плантации рекомендуется размещать желтые липкие доски или горшки. Также атаку вредителей снижает покрытие небольших насаждений специальной сеткой. Рядом с луком также рекомендуется высаживать растения, которые отталкивают луковую муху своим ароматом, например, ромашку, морковь, сельдерей, мяту и помидоры. Также могут использоваться растительные вещества, которые имеют интенсивный аромат: полынь, табак, молотый перец, одуванчик, розмарин, мята и хвойные растения.