Хоча для базової обрізки плодових дерев ще рано, можна обрізати більш товсті гілки, що запобігає появі небажаних пагонів. Пізньої осені рослина відчуває менше стресу під час обрізки, і мало шансів, що збудник осяде на рані, спричиненій обрізанням. Інструмент, який використовується для обрізки (спеціальні ножиці та пилки), повинен бути гострим і продезінфікованим. Також місця зрізу необхідно покрити воском для дерев. Обрізку роблять у сонячний теплий день, без дощу та туману. Слід уникати обрізки плодових дерев при температурі нижче 5 °С. Протягом пізньої осені можна проводити обрізання зламаних, висушених або пошкоджених чи заражених гілок. Їх повністю видаляють. Також рекомендується видаляти та збирати муміфіковані плоди, які можуть бути потенційним джерелом зараження. Яблука, груші можна знімати після опадання листя, а кісточкові плоди (слива, персик, абрикос, вишня), безумовно, пізніше, але обрізку слід проводити так, щоб завершити її до початку вегетації (березень - початок квітня). Зимова обрізка найбільш сприятливо впливає на ріст і розвиток пагонів і листя, а весняна — збільшує кількість плодів.