Температурний режим надзвичайно важливий для успішного вирощування овочів на спорудах захищеного ґрунту (теплиці, парники). Оптимальна температура повітря в захищеній території, де вирощують перець вдень, повинна бути близько 22 градусів тепла, тоді як вночі вона підтримується між 16 і 20 градусами тепла. Температура повітря нижче 14 градусів під час плодоношення перцю може спричинити різні негативні наслідки, такі як поява більшої кількості деформованих плодів. Особливо для всіх видів овочів коливання температури несприятливі, тобто його раптове підвищення та раптове зниження. Таким чином, оптимально, щоб температура зростала і знижувалась лише на 2-3 градуси С протягом однієї години. З іншого боку, температура ґрунту вдень повинна бути на 3 градуси С вище, тобто нижче вночі порівняно з температурою повітря. А температура ґрунту набагато стабільніша за температуру повітря і завжди вище в поверхневому шарі. Крім того, невідповідність температури повітря і ґрунту є однією з найпоширеніших причин затримки росту рослин. Іншими словами, через дещо нижчу температуру ґрунту активність коренів сповільнюється, що своєю чергою призводить до в’янення листя через те, що рослини не можуть поглинати достатню кількість води. Через усе це ми повинні особливо подбати про температуру всередині споруд захищеного ґрунту.