Непрямі заходи захисту полягають у боротьби зі шкідниками, що пошкоджують плоди. Необхідно контролювати таких шкідників, як вишнева муха (Rhagoletis crasi), персикова моль (Anarsia lineatella), плодожерка східна (Cydia molesta), сливова моль (Cydia funebrana та C. prunivora), та хворобу порожнистість листя (Stignima carpofila). Бажано видалити гнізда шершнів і ос. Навесні необхідно зібрати всі муміфіковані плоди, що залишилися на гілках або впали на землю. Якщо навесні їх не зібрати, утворюються конідії, які заражають плоди. З хімічних заходів для боротьби з плодовою гниллю використовують препарати з діючою речовиною боксалід, фенгексамід, флуопірам та тебуконазол. Важливо зазначити, що коли хвороба виникла, боротися з нею вже пізно!