Оскільки цитрусові також вирощують у горщиках як декоративні рослини, їх обрізка важлива з естетичних міркувань. Обрізка складається з утворення сферичного навісу і витончення. Навіси проріджують щороку в кінці зими, перед початком вегетації. Занадто довгі гілки, або ті, що ростуть всередину, обрізаються. Різка обрізка дає більш вегетативні і менш родючі бруньки. Більш слабка обрізка або відсутність обрізки розвиває менший плід гіршого стану. Обрізку проводять лезом у напрямку до дерева. Гілки зазвичай не обрізають, а видаляють. Після посадки саджанці вкорочують: на висоті формування крони, і ті гілки, від яких ми хочемо викликати гілкування бічних бруньок. Видаляючи гілки, утворюється ріст пагона і видаляються конкурентні гілки. Кількість видалених гілок і різкість зрізу визначають стан, урожайність і пишність дерева. Всі тонші гілки слід обрізати, щоб стимулювати ріст більших. Кожен зріз потрібно робити під кутом 45 °C, стежачи, щоб не пошкодити основну гілку. Після зими цитрусові дерева, якщо їм недостатньо світла, скидають частину листя. Тому оголені зелені пагони необхідно вкоротити, пам'ятаючи про форму кулястої крони. Якщо рослина захищена від вимерзання, невелику обрізку можна робити протягом року. Після обрізки лимонне дерево важливо добре поливати і удобрювати.