Присутність шкідника можна зареєструвати візуальним оглядом, помітивши ознаки нападу на плоди: про наявність у плодах личинок або лялечок можуть свідчити невеликі отвори в плодах, оточені гниллю. Якщо симптоми є на плодах, відбирають зразки для аналізу. Застосування феромонів та феромоноуловлювачів неможливе, оскільки цей вид не виробляє статевих феромонів, які залучають особин одного виду під час спарювання, але копуляція відбувається в місці годівлі, тобто на плодах, які залучають для їжі особин обох статей цього виду. Дрозофіла завдає шкоди безпосередньо перед збором урожаю, а тому захист хімічними засобами ускладнений через тривалість періоду очікування. Також ускладнює хімічний захист й спосіб розвитку личинки, що відбувається всередині плодів. Застосовувати інсектициди у якості профілактики, тобто до появи дрозофіли, не потрібно, оскільки вони не зменшують чисельність цього шкідника і водночас можуть призвести до зменшення популяції корисних комах, хижаків та носіїв пилку. Крім того, інсектициди, що застосовуються проти дрозофіли, годяться для обробки не всіх видів плодів, що вимагає перевірки перед застосуванням з обов’язковим читанням інструкції. Також, оскільки йдеться про стиглі плоди, необхідно враховувати термін виведення застосовуваних препаратів та визначення часу збору врожаю. Застосування агротехнічних заходів відіграє вирішальну роль у боротьбі з цим шкідником: скорочення періоду між збором плодів та детальним збиранням врожаю, обрізка та видалення заражених плодів, контроль ящиків та іншої упаковки, гігієна країв ділянок, на яких можна зустріти господарів цього шкідника від стихійної флори, масове полювання через мисливські пастки.