Перший і основний захід - сівозміна, рекомендується не саджати цибулю на одному місці 4 роки підряд. Її слід посадити як мінімум за 400 м від сусідніх плантацій цибулі та місць, де її садили минулого року. Цибулю також можна захистити від шкідника шляхом вищипування або видалення заражених частин і більш раннього чи пізнього посіву рослини. У плантації рекомендується розміщувати жовті липкі дошки або горщики. Також атаку шкідників зменшує покриття менших площ насаджень спеціальною сіткою. Поруч із цибулею рекомендується висаджувати рослини, які відштовхують цибулеву муху своїм ароматом, наприклад, ромашку, моркву, селеру, м’яту та помідори. Також можуть використовуватися рослинні речовини, що мають інтенсивний аромат, такі як полин, тютюн, мелений перець, кульбаба, розмарин, м'ята та хвойні рослини